Boa noite
Montagem de som é algo muito pessoal, depende do que você quer e do que está disposto a gastar para isso, além da preferencia por marcas mas segue uma pequena dica para quem tem o radio original e não abre mão muitas vezes dos comandos no volante.
http://www.taramps.com.br/produtos.php?cat2=419∏=1443
Este módulo trabalha com entrada a fio e com cortes de frequência ajustáveis, os alto falantes são da sua escolha lembrando que o módulo tem uma saída sub de 200Wrms a 4 ohms e 2 estereo a 2 ohms. que garantem um bom som de qualidade com leve reforço nos graves seja com os alto falantes originais ou com kits duas vias (minha preferência), ou como você disse, 6x9 no tampão.
Prefiro os kits duas vias por serem mais discretos, proporcionarem mais qualidade de som.
os kits cs60d e cs50d da bravox são uma ótima pedida pra quem quer mais qualidade e potência.
Espero ter ajudado